Následkom zrušenia vojenskej prokuratúry prešli vojenskí prokurátori a ich prípady spolu s administratívou pod prokuratúru všeobecnú, a začali sa venovať aj bežným prípadom. Taktiež pokračovali v práci na prípadoch ktoré pred tým spadali pod prokuratúru vojenskú.

Vojenské súdy boli zrušené už v roku 2009 za Ficovej vlády, a ich právomoci prešli pod tri okresné a jeden krajský súd so špecializovanou agendou. Dôvodová správa (rtf) k návrhu novely uvádza, že po zrušení vojenských súdov sa územné obvody prokuratúry nezhodovali s územnými obvodmi súdov ako je tomu pri všeobecnej prokuratúre. Keďže neexistovali samostatné vojenské súdy, navrhovatelia zákona nevideli dôvod pre pokračovanie samostatnej vojenskej prokuratúry, a jej právomoci prešli na tie obvody v ktorých sa nachádzajú špecializované súdy.

Miroslav Beblavý hlasoval za zrušenie vojenskej prokuratúry.