ÚPN by malo podľa dostupných informácií pracovať 67 pracovníkov. V priebehu roka 2012 počet pracovníkov klesol oproti roku 2011 o šesť zamestnancov. Ondrej Kraňák síce neuvádza úplne presné číslo počtu zamestnancov, no nachádza sa v prípustnej tolerancii.
Podľa poslednej Výročnej správy za rok 2011 (s. 8) pracovalo k 31. decembru 2011 v Ústave pamäti národa 73 zamestnancov.
"Celkový počet zamestnancov sa tak v priebehu roka znížil a k 31. decembru 2011 dosiahol počet 73. Z toho sedem zamestnancov pracovalo na skrátený úväzok a štyri pracovníčky boli na rodičovskej dovolenke."
12. januára 2012 informoval predseda Správnej rady ÚPN Ivan A. Petranský o zložitej finančnej situácií, ktorej vyústením bolo prepustenie deviatich ľudí.
"Ústav pamäti národa bol z dôvodu dlhodobo zložitej finančnej situácie nútený pristúpiť k redukcii počtu svojich zamestnancov. Celkovo sa tento postup dotkne deviatich ľudí – ide o dvoch riaditeľov sekcií a siedmich odborných referentov... V súčasnosti má ústav 73 zamestnancov (k 31. decembru 2011, pozn.), schválená dotácia na mzdy a odvody je však približne o 180 tisíc eur nižšia, než je potrebné na uvedený počet pracovníkov. ÚPN nemá záujem znižovať počet svojich pracovníkov, preto v prípade, že sa zvýši dotácia pre ÚPN zo štátneho rozpočtu, ústav výpovede zamestnancov prehodnotí."
O plánovanom prepúšťaní informovala 10. februára 2012 aj agentúra SITA.
Vo februári sa finančnou situáciou ÚPN zaoberalo Ministerstvo financií, ktoré malo prehodnotiť požiadavku vedenia ÚPN o mimoriadnu dotáciu 140 tisíc euro, ktoré malo aspoň čiastočne zabrániť prepusteniu zamestnancov.
"Dotácia pre ÚPN zo štátneho rozpočtu sa zatiaľ podľa Petranského nezmenila, takže situácia zostáva rovnaká, teda nemôže prísť k prehodnoteniu výpovedí viacerým zamestnancom. Podľa neho je potrebné navýšiť dotáciu o takmer 200 000 eur."
V januári 2012 sa objavili hlasy prepustených zamestnancov, ktorý hovorili, že ide viac o prepúšťanie nepohodlných ako problém nedostatku financií. O celej situácii ohľadom prepúšťania, nedostatku financií, ako aj reakcií prepustených si môžete prečítať tu.
V marci dostal ÚPN dotáciu vo výške takmer 60 tisíc eur a namiesto deviatich pracovníkov prepusti len 6. Konečný počet pracovníkov v ÚPN by mal byť 67.
"Šéf Ústavu pamäti národa (ÚPN) a nominant SNS Ivan Petranský stiahne tri z deviatich výpovedí, ktoré začiatkom roka rozdal zamestnancom ústavu. Boli medzi nimi aj jeho kritici, čo mu vyčítali disidenti, politickí väzni aj niektorí politici. ÚPN sa teraz podarilo získať dotáciu 57-tisíc eur od ministerstva financií, o ktorú Petranský požiadal až po výzve prepúšťaných. ...Hodnotiť, ako činnosť ústavu odchod šiestich ľudí poznačil, je zatiaľ podľa neho predčasné."
Výročná správa za rok 2012 nie je k dnešnému dňu prístupná.