Na druhej strane, samostatné riadenie tejto oblasti hospodárstva do veľkej miery závisí od Spoločnej poľnohospodárskej politiky EÚ, ktorej prijatie je dôsledkom vstupu Slovenskej republiky do EÚ. Najväčším problémom tejto politiky EÚ je nerovnosť podmienok medzi starými a novými členskými štátmi EÚ, ktoré mali byť odstránené do konca roka 2012, pričom už dnes je zrejmé, že sa tak nestane.
Nerovnosť medzi starými a novými členskými krajinami v otázke Spoločnej poľnohospodárskej politiky (SPP) sú často diskutovanou a aj kritizovanou témou. Portál reginvest.sk opisuje vo svojom sprievodcovi po SPP túto situáciu takto: