Máriu Kolíkovú v roku 2006 vtedajšia ministerka spravodlivosti Lucia Žitňanská vymenovala ako prvú riaditeľku Centra právnej pomoci. V tom istom roku ju z tohto postu odvolal Štefan Harabín ako ďalší minister spravodlivosti. V roku 2010 počas vlády Ivety Radičovej sa Mária Kolíková stala štátnou tajomníčkou ministerstva spravodlivosti, ktorého ministerkou v tom čase bola Lucia Žitňanská. Funkciu štátnej tajomníčky ministerstva spravodlivosti opustila v auguste 2018. Svoj odchod zdôvodnila vyjadrením, že so súčasným ministrom spravodlivosti Gáborom Gálom nenašla zhodu vo viacerých oblastiach ale jej odchod súvisel aj s únosom vietnamského občana Trinh Xuan Thanha. Vo funkcii štátnej tajomníčky ministerstva spravodlivosti ju 23. augusta 2018 nahradila Edita Pfundtner. Mária Kolíková počas činnosti v štátnej správe nikdy nebola členkou strany MOST-HÍD. Súvislosti s týmto pre DenníkN povedala: "Nie som jeho (strany MOST-HÍD, pozn.) členom a ani nie som súčasťou žiadnych rozhovorov vnútri strany." Výrok hodnotíme ako pravdivý.