Cieľom nadácie je obmedzenie korupcie a jej negatívnych dôsledkov na kvalitu života a podnikateľského prostredia na Slovensku. Ďalej sa snaží o podporu investigatívnej žurnalistiky a presadzovaniu opatrení na boj proti korupcii. 

Nadácia sa tiež venuje konkrétnym protikorupčným programom ako je Osveta a vzdelávanie, Protikorupčná legislatíva či Podpora investigatívy. Zastavme korupciu je hlavným partnerom ocenenia Biela vrana. Tá sa udeľuje občanom, ktorí prejavili občiansku odvahu a bránili verejný záujem.  

Kiska sa v apríli 2015 stretol so zakladateľmi nadácie a vyjadril sa, źe ich prácu si váži a podporuje ju. Prezident po stretnutí tiež uviedol, že: "Kedykoľvek bude nadácia cítiť, že prezident sa má ozvať a pomenovať, čo zlyháva z pohľadu skutočného odstraňovania korupcie, tak som sľúbil, že sa určite ozvem." Avšak prezident Kiska sa stretáva a vyjadruje podporu mnohým aktivitám občianskej spoločnosti. 

Práve nadácia Zastavme korupciu v novembri upozornila na údajne predražený nákup zdravotníckeho vybavenia Nemocnicou sv. Michala v Bratislave. V reakcii na to Fico uviedol, že nadácia je účelovo založená a má byť prípravou na Kiskovu budúcu politickú stranu. Podobné informácie priniesli už skôr v roku 2016 nie príliš dôveryhodné spravodajské zdroje. Kiska sa navyše ku kauze predraženého vybavenia nemocnice zatiaľ oficiálne nevyjadril, a teda ani nijako nekomentoval aktivity nadácie v tejto oblasti. 

Nadácia Zastavme korupciu už reagovala na premiérove výroky. Ako uvádza vo svojom stanovisku ,,tvrdenie o založení Nadácie z politických dôvodov nemá s realitou nič spoločné." 

Zastavme korupciu ďalej dodáva, že Trnka sa aj naďalej do politiky vstúpiť nechystá - ,,Miroslav Trnka sa už mnohokrát vyjadril, že nikdy nezvažoval vstup do politiky. A ako v posledných týždňoch vyhlásil aj pre viaceré slovenské médiá, na tomto svojom postoji nemieni nič meniť ani v budúcnosti." 

Podľa nadácie sú ,,premiérove obvinenia tiež nenáležitým spochybňovaním osobnej integrity zakladateľov Nadácie - Miroslava Trnku a Michala Bláhu."