Kontrolu policajných jednotiek má na starosti niekoľko jednotiek v rámci Ministerstva vnútra SR a Policajného zboru. Sú síce označené ako nezávislé,  kompetenčne a personálne podriadené priamo iba ministrovi vnútra SR, nemení to však fakt, že sa nachádzajú v štruktúrach MV SR a Policajného zboru SR.

Portál Ministerstva vnútra informuje, že "Sekcia kontroly a inšpekčnej služby Ministerstva vnútra Slovenskej republiky je samostatný útvar Ministerstva vnútra Slovenskej republiky, výlučne podriadený ministrovi vnútra Slovenskej republiky, nezávislý od riadenia a štruktúr polície, ktorý plní úlohy na úseku kontroly a inšpekčnej služby." Sekcia kontroly a inšpekčnej služby je "najmä gestorom vnútorného kontrolného systému, vybavovania sťažností  a petícií v pôsobnosti Ministerstva vnútra Slovenskej republiky" a "odhaľuje a vyšetruje trestnú činnosť príslušníkov Policajného zboru". Zaoberá sa aj so sťažnosťami na protiprávne konanie príslušníkov Policajného, Hasičského a záchranného zboru, príslušníkov Horskej záchrannej služby alebo zamestnancov Ministerstva vnútra Slovenskej republiky.

Na Policajnom prezídiu (P PZ) má túto agendu na starosti Odbor kontroly Prezídia Policajného zboru, ktorý medzi inými usmerňuje, vykonáva, zabezpečuje a vyhodnocuje kontrolnú činnosť na organizačných zložkách P PZ, na krajských riaditeľstvách PZ a okresných riaditeľstvách PZ, spolupracuje so sekciou kontroly a inšpekčnej služby MV SR pri plánovaní kontrolnej činnosti a pri odhaľovaní a prešetrovaní prípadov protiprávneho konania policajtov, vybavuje a prešetruje sťažnosti v rozsahu svojej pôsobnosti a kontroluje vybavenie sťažností, vykonáva kontrolu plnenia úloh a preventívnu činnosť na zamedzenie negatívnych javov vo výkone služby policajtov.

Kontrolu takisto vykonávajú aj útvary kontroly krajských riaditeľstiev Policajného zboru, prezídium Hasičského a záchranného zboru a krajské riaditeľstvá Hasičského a záchranného zboru.

Legislatívna úprava kontroly štátnej správy je ustanovená v Zákone o Kontrole štátnej správy z 10. decembra 1996.