Roman Mikulec bol v roku 2013 obvinený z ohrozovania utajovanej skutočnosti. V roku 2018 ho spod obžaloby najprv oslobodil prvostupňový okresný súd, ktorý konštatoval, že skutok sa nestal. Následne ho v roku 2019 definitívne oslobodil krajský súd, ktorý potvrdil jeho nevinu.

V roku 2013 bola pri vykonaní obhliadky v Mikulcovom vozidle zaistená pamäťová karta, na ktorej mal podľa obžaloby neoprávnene držať dokumenty označené ako dôverné a vyhradené. Podľa súdu sa však s touto kartou zaobchádzalo nesprávnym spôsobom a preto nebolo možné identifikovať ľudí, ktorí s ňou zaobchádzali. Rozsudok okresného súdu vyhlásil obžalovaného za nevinného a spôsob obdržania karty nazval amatérskym. Taktiež zhodnotil, že obsah dokumentov na karte nemal potenciál zasiahnuť do chránených záujmov republiky. 

Mikulec pracoval v rokoch 2010 až 2012, za vlády Ivety Radičovej, ako šéf vojenskej rozviedky a spolu s jeho zástupcom Vladimírom Suchodolinským vypracovali správu o podozreniach z tunelovania financií vojenskej spravodajskej služby počas vlády Smeru. Mikulec vyjadril presvedčenie, že žaloba zo strany štátu bola pomsta za vyšetrovanie tunelovania financií s kolegom Suchodolinským.